| 研究総括 | 河原林 健一 | 国立情報学研究所 教授・センター長 |
| 研究総括補佐 | 今井 和雄 | 国立情報学研究所 特任教授 |
| 研究推進主任 | 安藤 清 | 国立情報学研究所 特任教授 |
| 研究協力者 | Bruce Alan Reed | CNRS |
グラフマイニング&WEB&AIグループ
| グループリーダ | 河原林 健一 | 国立情報学研究所 教授・センター長 |
| グループサブリーダー | 林 浩平 | Preferred Networks |
| 研究員 | 薗部 知大 | 国立情報学研究所 特任研究員 |
| 研究員 | 小西 卓哉 | 国立情報学研究所 特任研究員 |
| 研究協力者 | 馬場 雪乃 | 筑波大学 / 国立情報学研究所 客員助教 |
| 研究協力者 | 大輪 拓也 | 富士通研究所 |
| 研究協力者 | 原 聡 | 大阪大学 |
| 研究協力者 | 波多野 大督 | 理化学研究所 |
| 研究協力者 | 鹿島 久嗣 | 京都大学 |
| 研究協力者 | 永野 清仁 | 公立はこだて未来大学 |
| 研究協力者 | Danushka Bollegala | リバプール大学 |
| 研究協力者 | 白井 朋之 | 九州大学 |
| 研究協力者 | 来嶋 秀治 | 九州大学 |
| 研究協力者 | 定兼 邦彦 | 東京大学 |
| 研究協力者 | 宇野 毅明 | 国立情報学研究所 |
| 研究協力者 | Michael Houle | 国立情報学研究所 |
| 研究協力者 | 中山 英樹 | 東京大学 |
| 研究協力者 | 柳沢 弘揮 | IBM |
| 研究協力者 | 恐神 貴行 | IBM |
| 研究協力者 | 小宮山 純平 | 東京大学 |
| 研究協力者 | 小池 敦 | 一関工業高等専門学校 |
| 研究協力者 | 渋谷 哲朗 | 東京大学 |
| 研究協力者 | 小野寺 拓 | 東京大学 |
| 研究協力者 | 斎藤 翔太 | アマゾン ウェブ サービス ジャパン株式会社 |
| 研究協力者 | 今泉 允聡 | 統計数理研究所 |
| 研究協力者 | 高濱 隆輔 | 株式会社scouty |
| 研究協力者 | 内橋 堅志 | 株式会社フリークアウト |
| 研究協力者 | 大田 浩史 | 東京大学 学振DC |
| シニアアドバイザー | 中川 裕志 | 東京大学 |
| 旧メンバー RA | Alex Bowe | （2013.1 － 2015.8 総合研究大学院大学） |
| 旧メンバー RA | Oussama Chelly | （2013.11 － 2017.2 総合研究大学院大学） |
複雑ネットワーク・地図グラフグループ
| グループリーダ | 吉田 悠一 | 国立情報学研究所 准教授・副センター長 |
| リサーチアシスタント | 稲荷場 渉 | 東京大学 |
| リサーチアシスタント | 村井 翔悟 | 東京大学 |
| 研究協力者 | 西 遼佑 | 鳥取大学 |
| 研究協力者 | 堀田 結孝 | 帝京大学 |
| 研究協力者 | 高口 太朗 | LINE |
| 研究協力者 | 江崎 貴裕 | 科学技術振興機構 さきがけ研究者 / 東京大学 |
| 研究協力者 | 照山 順一 | 関西学院大学 |
| 研究協力者 | 阿部 真人 | 理化学研究所 |
| 研究協力者 | 関口 卓也 | 理化学研究所 |
| 研究協力者 | 増田 直紀 | ブリストル大学 |
| 研究協力者 | 長谷川 雄央 | 茨城大学 |
| 研究協力者 | 稲葉 一浩 | |
| 研究協力者 | 楠本 充 | Preferred Networks |
| 研究協力者 | 秋葉 拓哉 | Preferred Networks |
| 研究協力者 | 岩田 陽一 | 国立情報学研究所 |
| 研究協力者 | 川本 達郎 | 産業技術総合研究所 |
| 研究協力者 | 河田 祐樹 | |
| 研究協力者 | 佐野 幸恵 | 筑波大学 |
| 研究協力者 | シュパイデル 玲雄 | オックスフォード大学 |
| 研究協力者 | 矢野 洋祐 | |
| 研究協力者 | 大坂 直人 | NEC |
| 研究協力者 | 林 孝紀 | |
| 研究協力者 | George Fletcher | アイントホーフェン工科大学 |
| 研究協力者 | Lucien Valstar | アイントホーフェン工科大学 |
| 研究協力者 | 深代 麻緒 | |
| シニアアドバイザー | 今井 浩 | 東京大学 / 国立情報学研究所 客員教授 |
| シニアアドバイザー | 岩間 一雄 | 京都大学 |
| 旧メンバー 研究員 | 久野 遼平 | （2013.10 – 2014.3 国立情報学研究所） |
| 旧メンバー RA | 岡 圭吾 | Google （2012.11 – 2014.3 東京大学） |
| 旧メンバー RA | 斎藤 宏大 | （2012.11 – 2014.1 東京大学） |
| 旧メンバー RA | 竹内 大樹 | （2012.11 – 2014.1 東京大学） |
| 旧メンバー RA | 村井 義孝 | （2013.11 – 2015.3 東京大学） |
| 旧メンバー RA | 生田 拓人 | （2014.5 – 2015.3 東京大学） |
グラフ・ネットワークにおける理論と最適化グループ
| グループリーダ | 垣村 尚徳 | 慶應義塾大学 / 国立情報学研究所 客員准教授 |
| グループサブリーダー | 小林 佑輔 | 京都大学 / 国立情報学研究所 客員准教授 |
| 研究員 | 町出 智也 | 国立情報学研究所 特任研究員 |
| 研究員 | Lin Bingkai | 国立情報学研究所 特任研究員 |
| 研究員 | Gregory Schwartzman | 国立情報学研究所 特任研究員 |
| リサーチアシスタント | 南川 智都 | 東京工業大学 |
| リサーチアシスタント | Donghao Zhu | 東京大学 |
| リサーチアシスタント | 林 興養 | 東京大学 |
| リサーチアシスタント | 達川 愛美 | 東京工業大学 |
| 研究協力者 | 前原 貴憲 | 理化学研究所 / 国立情報学研究所 客員助教 |
| 研究協力者 | Vorapong Suppakitpaisarn | 東京大学 / 国立情報学研究所 客員助教 |
| 研究協力者 | Benjamin Rossman | トロント大学 |
| 研究協力者 | 小関 健太 | 横浜国立大学 |
| 研究協力者 | 福永 拓郎 | 理化学研究所 |
| 研究協力者 | 澄田 範奈 | 首都大学東京 |
| 研究協力者 | 渋田 紀恵 | |
| 研究協力者 | Sankar Deep Chakraborty | 東京大学 |
| 研究協力者 | 岩田 覚 | 東京大学 / 国立情報学研究所 客員教授 |
| 研究協力者 | 伊藤 大雄 | 電気通信大学 |
| 研究協力者 | 梅谷 俊治 | 大阪大学 |
| 研究協力者 | 神山 直之 | 九州大学 |
| 研究協力者 | 脇 隼人 | 九州大学 |
| 研究協力者 | 河村 彰星 | 九州大学 |
| 研究協力者 | 木村 慧 | 豊橋技術科学大学 |
| 研究協力者 | 山口 勇太郎 | 大阪大学 |
| 研究協力者 | 河瀬 康志 | 東京工業大学 |
| 研究協力者 | 相馬 輔 | 東京大学 |
| 研究協力者 | 宮内 敦史 | 理化学研究所 |
| 研究協力者 | 平石 秀史 | 東京大学 |
| 研究協力者 | 横井 優 | 国立情報学研究所 |
| 研究協力者 | 松岡 達也 | 東京大学 学振DC |
| 研究協力者 | 平原 秀一 | 東京大学 学振DC |
| 研究協力者 | 岩政 勇仁 | 東京大学 学振DC |
| 研究協力者 | 東野 克哉 | NEC |
| 研究協力者 | 藤井 海斗 | 東京大学 学振DC |
| 研究協力者 | 黒木 祐子 | 東京大学 学振DC |
| 研究協力者 | 清水 伸高 | 東京大学 |
| 研究協力者 | 大城 泰平 | 東京大学 学振DC |
| 研究協力者 | 米林 悠真 | 三菱UFJモルガン・スタンレー証券株式会社 |
| 研究協力者 | 知野 孝祐 | |
| シニアアドバイザー | 室田 一雄 | 首都大学東京 |
| 旧メンバー RA | 金澤 康平 | （2013.1 – 2014.3 東京大学） |
| 旧メンバー RA | タン グエン ハウ | （2013.1 – 2014.3 東京大学） |
| 旧メンバー RA | 石原 響太 | （2013.5 – 2014.3 東京大学) |
| 旧メンバー RA | 大槻 兼資 | NTTデータ数理システム （2013.1 – 2015.3 東京大学） |
| 旧メンバー RA | 伊藤 伸志 | NEC （2013.5 – 2015.3 東京大学） |
| 旧メンバー RA | 吉川 和 | 富士通 （2013.5 – 2015.3 東京大学） |
| 旧メンバー RA | 矢部 顕大 | NEC （2013.4 – 2015.3 東京大学） |
| 旧メンバー RA | 池下 林太郎 | 日立製作所 （2014.6 – 2015.3 東京大学） |
| 旧メンバー RA | 丸茂 直貴 | （2014.6 – 2016.2 東京大学） |
| 旧メンバー RA | 赤木 康紀 | （2014.6 – 2016.2 東京大学） |
| 旧メンバー RA | 副島 真 | （2015.5 – 2016.2 東京大学） |
| 旧メンバー RA | 中村 渉 | （2015.5 – 2016.3 東京大学） |
| 旧メンバー 研究員 | Ioannis Avramopoulos | （2016.3 – 2016.8 国立情報学研究所） |
| 旧メンバー RA | 豊岡 祥 | NTTデータ数理システム（2015.5 – 2017.2 東京大学） |
| 旧メンバー RA | 佐藤 良亮 | 三井住友海上火災保険株式会社（2016.5 – 2018.2 東京大学） |
ネットワーク・アルゴリズムグループ
| グループリーダ | 徳山 豪 | 東北大学 / 国立情報学研究所 客員教授 |
| グループサブリーダー | 塩浦 昭義 | 東京工業大学 / 国立情報学研究所 客員准教授 |
| リサーチアシスタント | 水田 遥河 | 東北大学 |
| 研究協力者 | Matias Korman | 東北大学 / 国立情報学研究所 客員助教 |
| 研究協力者 | Jean-Francois Baffier | 東京工業大学 |
| 研究協力者 | André van Renssen | シドニー大学 |
| 研究協力者 | Marcel Roeloffzen | アイントホーフェン工科大学 |
| 研究協力者 | Chiu Man Kwun | ベルリン自由大学 |
| 研究協力者 | 加藤 寧 | 東北大学 |
| 研究協力者 | 周 暁 | 東北大学 |
| 研究協力者 | 赤松 隆 | 東北大学 |
| 研究協力者 | 篠原 歩 | 東北大学 |
| 研究協力者 | 西山 大樹 | 東北大学 |
| 研究協力者 | 伊藤 健洋 | 東北大学 |
| 研究協力者 | 宮田 洋行 | 群馬大学 |
| 研究協力者 | 浅野 哲夫 | 北陸先端科学技術大学院大学 |
| 研究協力者 | 田村 祐馬 | 一般財団法人 日本海事協会 |
| 研究協力者 | 畑中 達彦 | 東北大学 学振DC |
| 研究協力者 | 黄 軼倫 | NTTデータ |
| 旧メンバー 研究員 | Lorenz Klaus | （2013.2 – 2015.1 国立情報学研究所） | |
| 旧メンバー 研究員 | Kaothanthong Natsuda | タマサート大学 （2014.4 – 2014.5 国立情報学研究所） | |
| 旧メンバー RA | 太田 佳来 | （2012.11 – 2013.3 東北大学） | |
| 旧メンバー RA | 周 夢 | （2012.11 – 2014.3 東北大学） | |
| 旧メンバー RA | 遠藤 和樹 | （2012.11 – 2014.3 東北大学） | |
| 旧メンバー RA | 宮下 栄臣 | （2012.11 – 2014.3 東北大学） | |
| 旧メンバー RA | 福田 俊 | 大日本印刷（2013.4 – 2015.2 東北大学） | |
| 旧メンバー RA | 余 翔 | （2016.4 – 2016.11 東北大学） | |
| 旧メンバー RA | 原口 仁弥 | （2017.5 – 2018.2 東北大学） |
プロジェクトヘッドクォーター
| 研究推進員 | 津島 智子 | 国立情報学研究所 事務補佐員 |
| 研究推進員 | 中山 陽子 | 国立情報学研究所 事務補佐員 |
| JSTプロジェクト担当 | 佐藤 一美 | 科学技術振興機構 |
